More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1938 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  45.05 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  51.08 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  39.27 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  43.92 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  46.56 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  44.44 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  41 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  44.39 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  44.33 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  43.85 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  40.53 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  42.05 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  41.58 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  43.48 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  42.41 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  39.3 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  42.19 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  42.63 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  39.39 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  41.76 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  39.09 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  40.96 
 
 		 233 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  39.13 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  41.05 
 
 		 260 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  41.8 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  40.66 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  37.89 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  37.06 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  37.16 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  39.49 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  36.55 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  37.56 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  37.56 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  31.84 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  44.37 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  36.65 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  40.4 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  43.71 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  38.67 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  39.74 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  35.59 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  38.16 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  38.16 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  39.61 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  39.74 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  38.1 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  35.36 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  37.25 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  34.34 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  36.71 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  35.76 
 
 		 225 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  35.76 
 
 		 224 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  36.09 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  38.31 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  37.18 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.73 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  37.35 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  38 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  34.32 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.94 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  35.76 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  35.19 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  33.89 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  36.25 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  33.15 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  36.69 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  36.26 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  28.4 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  36.2 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  32.53 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  37.41 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  28.16 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  36.2 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  30.95 
 
 		 251 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  33.97 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>