More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5408 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  98.22 
 
 		 225 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  63.88 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  59.91 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  62.38 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  57.92 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  51.4 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  48.86 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  54.73 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  55.67 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  48.34 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  53.61 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  54.77 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  51.83 
 
 		 205 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  50.93 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  50.22 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  49.28 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  51.49 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  51.26 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  49.57 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  50.75 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  50.21 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  49.5 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  50.5 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  51.34 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  51.45 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  49.52 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  47.24 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  51.98 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  47.95 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  38.03 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  40.19 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  45.99 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  46.06 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  52.87 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.88 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  31.53 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  27.85 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  38.16 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  27.4 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  28.5 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  40.29 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  28.04 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  28.91 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  26.67 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  26.67 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  27.78 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  27.57 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  27.73 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  36.6 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  28.02 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  27.57 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  27.57 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  27.57 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  27.57 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  28.02 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  36.69 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  30.91 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  27.57 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.9 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  36.69 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  36.69 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  29.61 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  27.54 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  36.77 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  30.06 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  35.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  35.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  35.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  34.71 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  26.57 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  26.19 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  36.81 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  24.76 
 
 		 238 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  34.64 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  37.18 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  33.15 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>