More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7094 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  100 
 
 		 223 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  63.85 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  52.94 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  53.2 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  53.2 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  56.93 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  56.63 
 
 		 245 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  49.76 
 
 		 224 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  53.43 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  52.66 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  49.06 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  56.08 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  53.62 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  57.95 
 
 		 210 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  47.2 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  51.69 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  55.79 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  56.85 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  51.69 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  50.42 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  55.93 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  53.06 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  52.09 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  53.68 
 
 		 241 aa  174  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  49.75 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  47.93 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  49.33 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  48.76 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  59.35 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  53.22 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  46.89 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  49.75 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  43.13 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  53.8 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  48.99 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  61.78 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  50.8 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  53.37 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  32.87 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  43.66 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  33.94 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  34.65 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  37.82 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  31.67 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  33.71 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  34.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  29.44 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  34.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  32.77 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  28.37 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  37.71 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  36.25 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  32.48 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  30.43 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  36.2 
 
 		 235 aa  94.7  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  36.71 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  38.61 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  35.09 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  32.53 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  40.85 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.1 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.24 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  35.22 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  38.89 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.79 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  32.26 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.35 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  38.86 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  37.97 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>