More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0776 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  83.27 
 
 
256 aa  431  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  87.23 
 
 
235 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  47.01 
 
 
234 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  45.53 
 
 
234 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  44.4 
 
 
241 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  42.37 
 
 
240 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  43.48 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  46.15 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  43.53 
 
 
236 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  42.98 
 
 
238 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  41.84 
 
 
240 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  40.26 
 
 
242 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  43.93 
 
 
239 aa  192  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  40.34 
 
 
238 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  44.49 
 
 
240 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  39.66 
 
 
241 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  40.34 
 
 
239 aa  189  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  44.21 
 
 
242 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  41.6 
 
 
242 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  42.86 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  39.06 
 
 
240 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  39.08 
 
 
239 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  39.08 
 
 
239 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  40.43 
 
 
237 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 
238 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  39.91 
 
 
239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 
239 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  39.91 
 
 
239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  40.89 
 
 
239 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  42.67 
 
 
237 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  39.91 
 
 
239 aa  175  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  40.97 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  41.3 
 
 
251 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  39.65 
 
 
236 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  39.57 
 
 
240 aa  171  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  44.68 
 
 
240 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  37.66 
 
 
239 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  37.66 
 
 
239 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  43.87 
 
 
210 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  40.74 
 
 
250 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  40.54 
 
 
245 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  34.78 
 
 
240 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  38.72 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  37.38 
 
 
219 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  34.35 
 
 
240 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  40.29 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  39.32 
 
 
217 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  35.87 
 
 
231 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  40 
 
 
205 aa  138  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  31.91 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  40.26 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  36.74 
 
 
243 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  34.58 
 
 
238 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  33.94 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  34.38 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  36.74 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  35.89 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 
242 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  35.5 
 
 
231 aa  125  7e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  32.16 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  29 
 
 
235 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  35.32 
 
 
213 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  34.53 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  36.11 
 
 
215 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  36.32 
 
 
214 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  36.87 
 
 
236 aa  112  6e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
217 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  29.44 
 
 
248 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  33.48 
 
 
228 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  32.55 
 
 
215 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.4 
 
 
222 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  34.05 
 
 
228 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  31.02 
 
 
239 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  33.82 
 
 
229 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  34.4 
 
 
222 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  34.39 
 
 
216 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  37.84 
 
 
245 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  35.21 
 
 
220 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  33.64 
 
 
246 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  32.06 
 
 
228 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
216 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  31.1 
 
 
236 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  31.82 
 
 
222 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  35.05 
 
 
208 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  31.73 
 
 
228 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  31.73 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  31.73 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  31.03 
 
 
252 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  32.16 
 
 
235 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  30.62 
 
 
228 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  32.54 
 
 
231 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>