More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3427 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 
238 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  77.73 
 
 
238 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  363  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  71.43 
 
 
239 aa  364  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  71.43 
 
 
239 aa  364  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  363  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  363  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  363  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  363  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  363  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  362  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  71.43 
 
 
239 aa  362  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  71.01 
 
 
239 aa  349  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  63.16 
 
 
239 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  63.16 
 
 
239 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  61.84 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  58.51 
 
 
241 aa  285  5.999999999999999e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  54.2 
 
 
237 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  51.46 
 
 
239 aa  254  8e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  53.14 
 
 
238 aa  252  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  53.56 
 
 
237 aa  238  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  47.96 
 
 
241 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  47.49 
 
 
240 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  48.66 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  49.37 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  47.98 
 
 
239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  44.49 
 
 
240 aa  211  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  45.37 
 
 
236 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  47.46 
 
 
242 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  42.67 
 
 
239 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 
239 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  42.44 
 
 
242 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  41.78 
 
 
234 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  41.07 
 
 
238 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  44.6 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  39.91 
 
 
235 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  41.52 
 
 
234 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  41.96 
 
 
240 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  42.13 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  39.91 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.55 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  39.29 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  39 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  37.99 
 
 
251 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  39.55 
 
 
244 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 
245 aa  176  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  37.71 
 
 
240 aa  174  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  39.08 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  40.19 
 
 
238 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  38.89 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 
245 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  34.17 
 
 
241 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 
242 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  38.73 
 
 
205 aa  155  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  35.16 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  35.94 
 
 
240 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  35.94 
 
 
240 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  36.68 
 
 
239 aa  151  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  35.05 
 
 
251 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  36.57 
 
 
243 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  35.96 
 
 
231 aa  150  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  35.34 
 
 
231 aa  148  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 
235 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  34.6 
 
 
250 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  35.89 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  35.29 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  33.97 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  36.32 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  34.31 
 
 
228 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.31 
 
 
220 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  36.89 
 
 
217 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  35.92 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  34.31 
 
 
228 aa  129  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  33.61 
 
 
236 aa  126  3e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  34.62 
 
 
252 aa  124  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  34.58 
 
 
237 aa  122  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  30.8 
 
 
243 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  31.73 
 
 
215 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  29.91 
 
 
237 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  32.46 
 
 
217 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  33.82 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  35.24 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.1 
 
 
216 aa  118  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  34.43 
 
 
213 aa  118  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  34.2 
 
 
246 aa  118  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  29.02 
 
 
237 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  32.49 
 
 
231 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  30.47 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  29.07 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  29.63 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  31.98 
 
 
245 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  35.59 
 
 
201 aa  111  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  34.5 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  28.89 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  32.81 
 
 
221 aa  108  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.88 
 
 
205 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  30.88 
 
 
225 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  30.19 
 
 
220 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  33.18 
 
 
225 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>