More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0617 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  70.78 
 
 		 243 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  62.08 
 
 		 247 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  52.17 
 
 		 236 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  48.28 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  48.71 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  34.98 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  35.43 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  37.56 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  35.87 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  36.21 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  41.2 
 
 		 242 aa  154  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  38.03 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  34.18 
 
 		 251 aa  148  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  34.93 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.74 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  30.8 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  33.48 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  32.77 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.09 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  34.09 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  37.1 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  31.84 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.49 
 
 		 240 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 242 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  30.84 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  32.6 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  32.07 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  30.96 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  30 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  34.06 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  31.74 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  34.53 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  30.38 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  33.04 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  33.19 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  30.4 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  30.97 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  29.34 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  35.5 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  27.71 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  34.96 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  33.04 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  34.51 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  32.88 
 
 		 241 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  27.73 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  34.19 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.61 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  29.36 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  31.34 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  34.12 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  28.19 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  33.82 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42548  predicted protein  35.33 
 
 		 346 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0379002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  30.48 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  35.15 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  31.19 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  27.19 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  28.5 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  28.92 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  27.01 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  28.77 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  31.64 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  31.48 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>