More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1555 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  46.89 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  46.44 
 
 
242 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  45.73 
 
 
240 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  41.38 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  42.11 
 
 
239 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  40.34 
 
 
239 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  40.34 
 
 
239 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  39.92 
 
 
239 aa  178  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  40.76 
 
 
239 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  40.43 
 
 
239 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  40.43 
 
 
239 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  40.18 
 
 
234 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  37.71 
 
 
238 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  41.47 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  38.36 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  37.97 
 
 
239 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  39.82 
 
 
236 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  37.45 
 
 
241 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  40.71 
 
 
240 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  37.55 
 
 
239 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  40.43 
 
 
239 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  37.08 
 
 
242 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  40.45 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  39.48 
 
 
242 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  36.86 
 
 
239 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  40.52 
 
 
239 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  37.83 
 
 
235 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  43.33 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  38.26 
 
 
256 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  37.21 
 
 
245 aa  161  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  41.18 
 
 
240 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  33.47 
 
 
238 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  36.44 
 
 
251 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  37.66 
 
 
242 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  37.55 
 
 
237 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  37.99 
 
 
238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.87 
 
 
241 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  39.75 
 
 
231 aa  148  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  37.14 
 
 
240 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  34.8 
 
 
205 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  38.57 
 
 
255 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  37.67 
 
 
210 aa  142  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  37.5 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  33.2 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  38.53 
 
 
251 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  38.97 
 
 
238 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  36.77 
 
 
250 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  37.93 
 
 
243 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  37.71 
 
 
235 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  33.47 
 
 
242 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  31.62 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  41.35 
 
 
231 aa  125  5e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  37.29 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  33.61 
 
 
239 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  33.01 
 
 
217 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  30.8 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  36.87 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  36.87 
 
 
228 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  33.99 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  36.7 
 
 
231 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  37.31 
 
 
213 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  33 
 
 
217 aa  118  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  39.04 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  34.43 
 
 
237 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  33.48 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  30.81 
 
 
229 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  31.55 
 
 
261 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  35.15 
 
 
215 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  34.91 
 
 
237 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  34.93 
 
 
214 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  31.09 
 
 
209 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  28.35 
 
 
221 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  31.73 
 
 
247 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  33.48 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  41.94 
 
 
201 aa  99.4  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.27 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  33.97 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  31.05 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  32 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  29.29 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  29.41 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  31.92 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  27.23 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  34.13 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.74 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  31.41 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  35.11 
 
 
214 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>