More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3119 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  49.25 
 
 
237 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  44.39 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  39.05 
 
 
252 aa  144  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  35.27 
 
 
210 aa  122  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  34.55 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  36.32 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.44 
 
 
239 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  42.49 
 
 
205 aa  112  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  34.72 
 
 
238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 
242 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
240 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  36.96 
 
 
245 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  32.71 
 
 
236 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  28.5 
 
 
213 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  33.49 
 
 
250 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  35.32 
 
 
234 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  35 
 
 
240 aa  101  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  31.39 
 
 
241 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.67 
 
 
239 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  31.46 
 
 
238 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  29.72 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  35.88 
 
 
228 aa  99  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  36.28 
 
 
239 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  29.95 
 
 
251 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  38.46 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 
245 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  32.11 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  32.24 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  32.55 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  35.88 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  37.09 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  30.45 
 
 
255 aa  94.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  30.14 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  30.48 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  33.66 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.39 
 
 
237 aa  94  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  34.26 
 
 
235 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  32.55 
 
 
239 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  33.95 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 
239 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  30.52 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.04 
 
 
240 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
239 aa  91.7  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  31.34 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  32.02 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  29.63 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.18 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  37.34 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  35.21 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  31.39 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  38.86 
 
 
261 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  30.41 
 
 
229 aa  88.6  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  37.18 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  32.97 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30.52 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  29.11 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  32.38 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  29.11 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  31.82 
 
 
244 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  30.56 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  31.73 
 
 
220 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  33.02 
 
 
240 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  27.78 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  37.27 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  37.27 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  37.41 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  38.97 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  36.05 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  36.65 
 
 
228 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 
222 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 
207 aa  84.7  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  37.66 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  33.65 
 
 
236 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  32.09 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  35.19 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  29.72 
 
 
242 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  32.7 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.96 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  35.95 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>