More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0013 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  81.82 
 
 		 222 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  41.12 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  38.67 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  38.76 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  38.54 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  36.19 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  40.19 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  39.05 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  41.21 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  35.21 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  37.26 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  37.8 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  35.21 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  35.21 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  36.15 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  35.68 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  37.67 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.92 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  38.3 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  34.74 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  35.59 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  35.65 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  37.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  35.58 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  34.76 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  35.58 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  36.23 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  35.58 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  36.71 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  35.98 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  35.75 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  35.27 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.6 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  36.27 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  35.27 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  33.8 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  38.59 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1321  16S rRNA methyltransferase GidB  35.24 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.85 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  32.85 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  34.1 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.71 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  33.82 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  28 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  34.76 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  34.98 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.85 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  34.76 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  34.95 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  34.95 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  33.01 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  34.95 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  32.27 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  34.12 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  33.03 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  32.77 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  38.16 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  33.48 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  29.6 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  27.31 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  27.31 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  32.38 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  34.05 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  34.05 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>