More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0223 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  97.81 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  42.92 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  41.41 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  44.31 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  39.91 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  34.88 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  36.77 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  39.39 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  36.29 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.52 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  36.52 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  41.41 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  36.4 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  42.51 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  36.28 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  42.51 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  38.73 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  37.12 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  35.27 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  35.24 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  36.44 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  36.87 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  33.62 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  38.38 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  37.33 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  39.5 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  35.82 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  38.16 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  40.12 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  40.83 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  38.39 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  35.47 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  41.18 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  34.33 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.94 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1335  methyltransferase GidB  39.81 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0873735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  36.14 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  35.82 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  36.24 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  31.9 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  33.63 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  33.48 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  35.12 
 
 		 251 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  34.84 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  36.81 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  42.94 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  34.69 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  35.11 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  35.88 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  37.75 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  35.54 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  40.43 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  32.9 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  34.54 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  34.91 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  31.19 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  32.29 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  31.84 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  42.86 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  29.7 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  43.1 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  37.33 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.51 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  29.91 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>