More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0251 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  100 
 
 
231 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  64.94 
 
 
231 aa  298  6e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  42.58 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  44.08 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  39.64 
 
 
242 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  38.89 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  40.45 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  39.32 
 
 
239 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  41.59 
 
 
239 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  43.78 
 
 
238 aa  158  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  37.87 
 
 
241 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  37.89 
 
 
240 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  37.34 
 
 
239 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  37.34 
 
 
239 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 
238 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  39.21 
 
 
240 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  39.52 
 
 
242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  37.99 
 
 
251 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  37.87 
 
 
239 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 
238 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  35.59 
 
 
236 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  38.49 
 
 
239 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  39.75 
 
 
240 aa  148  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  35.39 
 
 
245 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  38.65 
 
 
210 aa  145  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  35.32 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  39.91 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  35.32 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  37.66 
 
 
239 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  34.19 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  36.99 
 
 
245 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 
239 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  36.91 
 
 
237 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  34.85 
 
 
239 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  39.22 
 
 
242 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  36.6 
 
 
242 aa  142  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  38.42 
 
 
242 aa  141  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  34.8 
 
 
235 aa  141  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 
234 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  35.19 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  38.89 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  37 
 
 
240 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  34.53 
 
 
238 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  39.29 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  33.92 
 
 
256 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  32.61 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  33.19 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  34.85 
 
 
251 aa  134  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  32.48 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  33.48 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  37.62 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  37.02 
 
 
236 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  38.5 
 
 
231 aa  126  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  38.1 
 
 
248 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  34.15 
 
 
205 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  37.81 
 
 
237 aa  122  5e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  36.59 
 
 
240 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  36.59 
 
 
240 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  37.44 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  36.77 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  38.05 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  33.82 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  37.56 
 
 
231 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.21 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  36.32 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  36.53 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  34.21 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  36.14 
 
 
261 aa  111  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  36.27 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  31.9 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  30.52 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 
226 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  34.39 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  32.87 
 
 
250 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  31.9 
 
 
228 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  30.39 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  32.85 
 
 
211 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  33.18 
 
 
243 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  34.94 
 
 
206 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  35.9 
 
 
245 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  31.6 
 
 
217 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  32.24 
 
 
217 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  35.05 
 
 
252 aa  105  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  29.22 
 
 
219 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  30.66 
 
 
217 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  30.7 
 
 
220 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.54 
 
 
207 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 
207 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.54 
 
 
207 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  34.91 
 
 
209 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 
207 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>