More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4009 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  57.52 
 
 
245 aa  269  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  53.25 
 
 
255 aa  260  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  52.14 
 
 
251 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  50.67 
 
 
240 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  56.28 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  50.22 
 
 
240 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  50.23 
 
 
242 aa  184  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  36.74 
 
 
235 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  35.75 
 
 
241 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 
248 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  38.24 
 
 
239 aa  142  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  38.16 
 
 
244 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  36.14 
 
 
240 aa  138  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  39.41 
 
 
242 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  35.98 
 
 
236 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  34.55 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  36.1 
 
 
241 aa  128  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  32.24 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  38.59 
 
 
240 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  36.51 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  33.66 
 
 
238 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  39.05 
 
 
236 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  36.02 
 
 
242 aa  125  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  31.84 
 
 
240 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  35.07 
 
 
240 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  32.67 
 
 
238 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  36.27 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  34.43 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  37.1 
 
 
243 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  30.88 
 
 
239 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 
239 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  34.54 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  36.87 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.34 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  37.56 
 
 
231 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  31.03 
 
 
239 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  34.85 
 
 
239 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  37.1 
 
 
237 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  32.35 
 
 
239 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  38.97 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  31.34 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  32.39 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  32.16 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.18 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  31.66 
 
 
237 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  34.34 
 
 
239 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  30.15 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  30.94 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  34.93 
 
 
241 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  31.34 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.95 
 
 
239 aa  111  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  30.95 
 
 
239 aa  111  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  36.69 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  31.37 
 
 
253 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  35.07 
 
 
215 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 
256 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  39.1 
 
 
237 aa  105  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
210 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  33.65 
 
 
212 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  32.52 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  31.74 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  33.65 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  38.67 
 
 
221 aa  98.6  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  33.49 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  34.47 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  35.37 
 
 
242 aa  94.7  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  32.89 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  34.67 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  32.54 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
234 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 
306 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  31.73 
 
 
228 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  37.14 
 
 
226 aa  92  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  32.45 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  32.45 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  27.98 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  37.58 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  32.85 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  33.16 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  32.65 
 
 
245 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  30.05 
 
 
251 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  32.07 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  28.77 
 
 
222 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4356  methyltransferase GidB  36.26 
 
 
215 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 
238 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  30.54 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  34.64 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>