More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3051 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  50.93 
 
 		 244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  47.93 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  40.34 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  37.76 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  40 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  37.19 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  39.17 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  40.71 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  42.24 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  39.08 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  39.17 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  39.81 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  43.16 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  40.74 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  43.97 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  43.36 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  38.56 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  40.44 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  40.28 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  37.08 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  39.27 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  38.79 
 
 		 239 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  38.79 
 
 		 239 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  39.72 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  38.71 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  40.65 
 
 		 251 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  41.47 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  38.71 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  39.72 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  39.48 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  39.27 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  38.97 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  39.52 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.02 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  36.21 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  40.93 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  34.93 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  40.47 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  36.76 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  39.2 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  39.05 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  34.74 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  38.68 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  37.67 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  38.89 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  38.38 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  39.22 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  33.03 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  33.78 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.98 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  32.85 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  33.33 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  33.97 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.85 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  34.18 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.96 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  34.4 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  35.64 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  36.7 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  31.79 
 
 		 212 aa  98.2  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.92 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  28.83 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  31.96 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.45 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  35.6 
 
 		 206 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  34.95 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  35.6 
 
 		 206 aa  95.5  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  32.13 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.9 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  32.99 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  35.6 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  33.03 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  27.48 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>