More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3195 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  48.15 
 
 
242 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  47.96 
 
 
245 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  43.61 
 
 
240 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  44.98 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  43.48 
 
 
256 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  45.91 
 
 
236 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  45.87 
 
 
253 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  46.58 
 
 
240 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  46.22 
 
 
240 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  45.41 
 
 
242 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  41.44 
 
 
239 aa  186  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  41.94 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  40.69 
 
 
238 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  40.08 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  40.55 
 
 
241 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  39.42 
 
 
240 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  37.18 
 
 
239 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  39.74 
 
 
238 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  45.06 
 
 
241 aa  177  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  39.3 
 
 
239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  42.59 
 
 
240 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  36.75 
 
 
239 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  42.67 
 
 
239 aa  175  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  38.82 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  39.63 
 
 
240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  43.58 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  41.99 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  38.43 
 
 
239 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  39.66 
 
 
237 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  40.27 
 
 
245 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  39.09 
 
 
238 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  41.96 
 
 
240 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  38.56 
 
 
241 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  38.43 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  42.47 
 
 
234 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  42.86 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  38.64 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  41.52 
 
 
240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  36.68 
 
 
239 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  36.68 
 
 
239 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  40.45 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  40.09 
 
 
242 aa  152  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  38.17 
 
 
238 aa  151  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  36.7 
 
 
238 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  41.44 
 
 
243 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  39.82 
 
 
251 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  35.96 
 
 
255 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  36.09 
 
 
237 aa  141  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  37.1 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 
236 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  40.98 
 
 
261 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  38.78 
 
 
231 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  37.68 
 
 
250 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  40.72 
 
 
205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  36.61 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  35.96 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  36.7 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  40.2 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  37.16 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  35.68 
 
 
239 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 
231 aa  121  8e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  41.83 
 
 
214 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  35.78 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  34.08 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  34.6 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  37.33 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  36.41 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  28.19 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  27.75 
 
 
237 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  30.14 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  32.86 
 
 
217 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  35.94 
 
 
215 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  33.49 
 
 
206 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  33.49 
 
 
206 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  37.77 
 
 
214 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  33.49 
 
 
206 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  30.22 
 
 
220 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  33.49 
 
 
206 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  32.87 
 
 
207 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  32.87 
 
 
207 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  32.87 
 
 
207 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  32.87 
 
 
207 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  32.87 
 
 
207 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  32.87 
 
 
207 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  32.87 
 
 
207 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  34.82 
 
 
210 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  32.43 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  32.41 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  35.4 
 
 
243 aa  99  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>