More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1364 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  37.39 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  39.05 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  36.62 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  34.89 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  35.04 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  35.87 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  31.78 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  35.87 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  34.02 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  36.06 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.24 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.63 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  37.81 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  34.96 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  35.44 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  32.49 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  31.36 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  35.45 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  34.09 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  32.22 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.36 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.36 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  31.36 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  32.64 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 210 aa  109  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  31.74 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  32.64 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  32.9 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  33.19 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  35.05 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.25 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  34.65 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  33.62 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  34.12 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  35.64 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  31.56 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  30.37 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  31.67 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  29.96 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  34.33 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  29.34 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  32.43 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  31.47 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  31.31 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  31.08 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 206 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  33 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  32.98 
 
 		 213 aa  95.9  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  28.5 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  36.26 
 
 		 211 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  33.17 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  33.48 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  36.22 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  28.02 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  29.71 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  32.9 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  37.1 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  29.82 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  30.84 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  38.89 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  31.78 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  32.86 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  31.78 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  31.72 
 
 		 209 aa  89.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  32.47 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 		 207 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>