More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1005 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 235 aa  486  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  98.3 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  50.64 
 
 		 247 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  53.51 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  48.28 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  47.21 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  43.05 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  42.15 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  41.7 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  43.98 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  37.29 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  40.17 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  39.74 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  38.14 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  39.48 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  39.64 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  39.06 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  39.82 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 251 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  38.67 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  37.29 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  34.98 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  36.2 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  36.77 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  34.82 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  38.12 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.82 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  36.77 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  37.34 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  36.74 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  37.71 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  38.25 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  37.28 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  35.22 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  37.62 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  35.81 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.7 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  33.04 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  33.04 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  35.55 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  31.7 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  35.87 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  36.4 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  33.94 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  30.8 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.19 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  30 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.39 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  35 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  29.55 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  33.63 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  31.08 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  35.82 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  31.96 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  38.15 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  31.63 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  31.16 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  29.27 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  36.26 
 
 		 205 aa  99.4  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  36.26 
 
 		 261 aa  98.2  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  30.85 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.84 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  34.26 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  31.02 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  29.5 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  30.43 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.84 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.92 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  30.19 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  29.56 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  34.84 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  29.56 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  32.56 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  29.56 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  29.56 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  29.56 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>