More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2147 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  100 
 
 
241 aa  464  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  47.64 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  46.55 
 
 
240 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  38.21 
 
 
240 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  38.6 
 
 
242 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  39.08 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  36.13 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  43.97 
 
 
242 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  45.05 
 
 
244 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  37.28 
 
 
241 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  37.45 
 
 
240 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  40.61 
 
 
236 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  38.24 
 
 
240 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  38.26 
 
 
239 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  38.2 
 
 
239 aa  164  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  37.18 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  37.18 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  42.67 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  36.09 
 
 
239 aa  162  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  40.87 
 
 
236 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.62 
 
 
237 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  34.17 
 
 
238 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  39.3 
 
 
235 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  38.67 
 
 
239 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  37.75 
 
 
242 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  41.33 
 
 
234 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  36.02 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  35.59 
 
 
239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  35.59 
 
 
239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  40.91 
 
 
210 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  44.12 
 
 
205 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  43.6 
 
 
251 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  39.32 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  38.46 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
239 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
239 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
239 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
239 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
239 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
239 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  40.93 
 
 
245 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  31.22 
 
 
239 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  31.22 
 
 
239 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  41.96 
 
 
234 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  35.74 
 
 
238 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
239 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  35.09 
 
 
237 aa  148  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  35.59 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  40.77 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  40.69 
 
 
242 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  39.91 
 
 
228 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.04 
 
 
241 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  39.53 
 
 
253 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  32.77 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  32.61 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  33.48 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  35.44 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  32.88 
 
 
240 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  32.88 
 
 
240 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 
245 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  31.74 
 
 
255 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  35.55 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  42.64 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  43.41 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  40.43 
 
 
239 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  36.71 
 
 
251 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  35.27 
 
 
219 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  36.02 
 
 
248 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  36.73 
 
 
213 aa  121  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  27.7 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  34.43 
 
 
243 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  32.49 
 
 
252 aa  115  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  34.93 
 
 
217 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  38.12 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  33.49 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  35.26 
 
 
231 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  29.9 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  37.24 
 
 
208 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  36.96 
 
 
222 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  36.57 
 
 
205 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  36.81 
 
 
222 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  31.46 
 
 
208 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  36 
 
 
229 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  40.69 
 
 
261 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.3 
 
 
220 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  31.46 
 
 
234 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 
205 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  34.23 
 
 
235 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  34.81 
 
 
238 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  34.25 
 
 
211 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 
210 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 
204 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 
223 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  27.8 
 
 
237 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  41.27 
 
 
220 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  31.39 
 
 
213 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  31.05 
 
 
216 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  37.85 
 
 
208 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 
211 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  39.56 
 
 
220 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>