More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2601 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  36.53 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  36.87 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  37.88 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  37.85 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.1 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.8 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  39.56 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  28.85 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  28.85 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  39.56 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  37.79 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.99 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  33.65 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  32.71 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  28.7 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  28.7 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  28.7 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  31.72 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  37.69 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  31.37 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  34.67 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  38.71 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  32.04 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  38.07 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  36.97 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.88 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  35.86 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  37.82 
 
 		 251 aa  89.4  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  47.47 
 
 		 250 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  33.97 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  32.57 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  30.85 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.45 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  39.47 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  36.3 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  32.02 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  30.85 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  35.21 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  40.87 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  40.34 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  41.74 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  39.34 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1152  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal  0.598174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  35.82 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  39.1 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  37.31 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  32.78 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  30.24 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  32.78 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  29.82 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.21 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  36.15 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  35.42 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  37.39 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  37.39 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  28.33 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  35.34 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1318  methyltransferase GidB  36.09 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0582047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  30.4 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  37.39 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.4 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  36.11 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  30.45 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>