More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0042 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  100 
 
 
219 aa  440  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  48.28 
 
 
212 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  45.52 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  39.6 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  42.47 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  43.9 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  42.47 
 
 
238 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  42.77 
 
 
234 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  39.19 
 
 
205 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  37.25 
 
 
242 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 
239 aa  104  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  33.92 
 
 
239 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  34.32 
 
 
239 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.32 
 
 
239 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  38.78 
 
 
213 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  37.04 
 
 
239 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  38.67 
 
 
209 aa  101  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  45.38 
 
 
215 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  35.22 
 
 
242 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  35.8 
 
 
239 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  35.58 
 
 
217 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  37.34 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  37.04 
 
 
221 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  41.72 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  43.7 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  35.58 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  38.46 
 
 
240 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  32.7 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  43.08 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  30.85 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  37.36 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  43.08 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  32.94 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  34.59 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  39.07 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  39.13 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  33.71 
 
 
239 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  31.68 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  32.37 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  43.9 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  33.71 
 
 
239 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  44.25 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  44.25 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  32.91 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  34.34 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  38.82 
 
 
217 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  36.25 
 
 
206 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 
206 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  36.13 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 
240 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 
206 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.33 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  33.97 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  33.75 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4511  methyltransferase GidB  37.84 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  32.74 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  38.41 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  27.88 
 
 
238 aa  92  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  30.13 
 
 
237 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  35.42 
 
 
235 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  34.59 
 
 
223 aa  92  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  32.94 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  42.86 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  43.24 
 
 
216 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  38.33 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  36.71 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  32.53 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  40.85 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  41.67 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  40.85 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  30.86 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  38.18 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  32.6 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  34.13 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>