More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0693 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  40.12 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  38.92 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  42.59 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  37.91 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  35.59 
 
 		 238 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  31.51 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  36.97 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  34.09 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  32.8 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  35.68 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  32.79 
 
 		 228 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  35.63 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  36.42 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  38.69 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  36.26 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  34.25 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  32.93 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 235 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  29.33 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  31.09 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.33 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  32.99 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  31.15 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  38.51 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  36.52 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  34.43 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  31.52 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  31.09 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  31.09 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  36.49 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  29.23 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  41.94 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  34.59 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.52 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 224 aa  98.2  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.09 
 
 		 241 aa  98.2  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  26.37 
 
 		 218 aa  97.8  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 221 aa  97.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  34.1 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  30.11 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  34.68 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  34.3 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  35.52 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  32.35 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>