More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2216 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  83.26 
 
 		 234 aa  384  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  59.74 
 
 		 238 aa  269  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  46.15 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  45.73 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  49.07 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  50.86 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  43.1 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  44.69 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  50.43 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  41.63 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  45.78 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  44.21 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  41.78 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  42.86 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  38.3 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  42.41 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  42.79 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  39.57 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  41.33 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  39.57 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  42.54 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  43.58 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  40.53 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  43.16 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  38.77 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  38.89 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  45.33 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  42.4 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  38.82 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  37.05 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  41.96 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  40.28 
 
 		 210 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  36.63 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  36.29 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  37.09 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  36.15 
 
 		 217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  34.09 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  41.18 
 
 		 205 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  34.63 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  41.95 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  38.14 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  37.85 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  36.71 
 
 		 251 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  42.79 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  36.48 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  33.19 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 228 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  31.33 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  37.38 
 
 		 220 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  38.1 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  35.85 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.08 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  39.8 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  35.65 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  43.9 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 217 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.06 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  30.8 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  40.3 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  31.51 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  38.16 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  33.64 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  35.24 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  41.05 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  36.21 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  39.79 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  35.54 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  33.02 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.8 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.52 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  31.31 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  38.01 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.18 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  25.45 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  37.43 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>