More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2084 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  99.17 
 
 
240 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  60.74 
 
 
245 aa  315  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  61 
 
 
251 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  60.25 
 
 
243 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  55.79 
 
 
255 aa  280  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  51.29 
 
 
242 aa  229  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  50.67 
 
 
231 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  40.17 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  38.91 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  41.96 
 
 
244 aa  168  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  39.04 
 
 
240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  40.6 
 
 
248 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  40.61 
 
 
236 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  39.82 
 
 
236 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  36.4 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  39.37 
 
 
238 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  39.37 
 
 
241 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  38.71 
 
 
242 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  39.46 
 
 
242 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  36.94 
 
 
239 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  36.94 
 
 
239 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  39.3 
 
 
240 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  37.55 
 
 
242 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.25 
 
 
239 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  40.44 
 
 
239 aa  155  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  35 
 
 
235 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  36 
 
 
239 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 
256 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  35.94 
 
 
238 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 
239 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 
239 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 
239 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 
239 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 
239 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  37.1 
 
 
245 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 
253 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  37.56 
 
 
241 aa  152  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  35.59 
 
 
239 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  34.55 
 
 
234 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 
239 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  38.05 
 
 
240 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  36.2 
 
 
239 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  36.2 
 
 
239 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  34.4 
 
 
240 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  36.89 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  37.02 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  35.92 
 
 
237 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  37.14 
 
 
240 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  36.89 
 
 
220 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  35.92 
 
 
237 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  36.82 
 
 
237 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  34.09 
 
 
234 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  36.2 
 
 
239 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  33.18 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  36.92 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  36.92 
 
 
239 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  35.06 
 
 
243 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  36.68 
 
 
242 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  35.32 
 
 
231 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  38.05 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  36.74 
 
 
210 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  32.88 
 
 
241 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  35.06 
 
 
243 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.96 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  37.5 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  35.56 
 
 
237 aa  122  6e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  36.59 
 
 
231 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  33.66 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  30.86 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  35.71 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  33.82 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  31.95 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  33.18 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  34.3 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  31.66 
 
 
245 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  35.78 
 
 
236 aa  103  3e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  33.94 
 
 
214 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  33.52 
 
 
228 aa  101  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  32.95 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  33.82 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  30.48 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  29.58 
 
 
219 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  31.25 
 
 
252 aa  92  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  31.25 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  31.09 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  27.07 
 
 
225 aa  89.7  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  32.04 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.8 
 
 
208 aa  89  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  30.43 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  36.59 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  30.94 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  30.94 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  32.43 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.99 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  25.11 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  30.39 
 
 
228 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>