More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1731 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  51.39 
 
 
240 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  50.47 
 
 
241 aa  201  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  45.54 
 
 
239 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  45.54 
 
 
239 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  44.6 
 
 
238 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  45.07 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  45.07 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  45.07 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  45.07 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  45.07 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  45.58 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  45.07 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  46.92 
 
 
239 aa  187  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  45.07 
 
 
239 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  44.6 
 
 
239 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  45.12 
 
 
239 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  45.58 
 
 
239 aa  184  7e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  44.39 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  44.39 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  45.28 
 
 
239 aa  178  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  46.76 
 
 
242 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  44.13 
 
 
239 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  44.6 
 
 
242 aa  176  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  46.48 
 
 
241 aa  174  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  43.72 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  41.78 
 
 
238 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  47.89 
 
 
242 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  46.19 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  44.6 
 
 
240 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  42.72 
 
 
237 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  42.86 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  44.34 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  42.25 
 
 
240 aa  164  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  43.4 
 
 
256 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  43.87 
 
 
253 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  44.29 
 
 
240 aa  161  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  42.31 
 
 
234 aa  158  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  44.55 
 
 
236 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  42.13 
 
 
239 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  40.91 
 
 
241 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  38.97 
 
 
242 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  40.28 
 
 
234 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
238 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  35.32 
 
 
245 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  40.78 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  38.65 
 
 
231 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  38.97 
 
 
238 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  37.75 
 
 
205 aa  142  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  43.37 
 
 
237 aa  142  5e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  37.67 
 
 
240 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  40.38 
 
 
251 aa  141  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  36.49 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  43.26 
 
 
237 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  37.98 
 
 
231 aa  138  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.02 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  39.09 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  37.44 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  38.89 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  40.53 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  36.74 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  36.74 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  36.7 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  38.33 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  36.23 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  37.37 
 
 
213 aa  124  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  38.74 
 
 
239 aa  124  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  35.27 
 
 
213 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  34.9 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  41.72 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  37.5 
 
 
243 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  38.6 
 
 
214 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  32.04 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  36.63 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.39 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  38.16 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  36.82 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  37.16 
 
 
206 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  39.34 
 
 
206 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  39.34 
 
 
206 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  40.27 
 
 
209 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  39.34 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  37.68 
 
 
228 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  36.31 
 
 
215 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  35.68 
 
 
211 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  35.59 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  34.05 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  35.83 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  32.8 
 
 
217 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  36.31 
 
 
220 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  34.43 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  38.41 
 
 
210 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  34.13 
 
 
225 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  33.15 
 
 
207 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  33.15 
 
 
207 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  33.15 
 
 
207 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  33.15 
 
 
207 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  33.15 
 
 
207 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 
227 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>