More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1568 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  85.23 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  85.23 
 
 		 237 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  71.1 
 
 		 220 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  42.15 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  42.51 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  42.15 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  35.87 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 243 aa  164  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04501  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  36.89 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  36.89 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  37.95 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  33.8 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  34.96 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  31.42 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  31.9 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  30.99 
 
 		 251 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  35.27 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  31.7 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  31.13 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  31.6 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  32.03 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  29.07 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  33.04 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  28.12 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  31.3 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  31.56 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.56 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.8 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  33.01 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  31.91 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  30.87 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  29.07 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  25.89 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  29.15 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  29.15 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  27.8 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  27.31 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  29.2 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  35.41 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  30.8 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  28.7 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  27.23 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  27.31 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  24.11 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 214 aa  92  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  23.66 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  24.77 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  30.92 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  26.34 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  31.33 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  28.71 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  30.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  27.91 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  31.1 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  25.91 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  28.26 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  24.3 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  26.7 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  26.61 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  28.88 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  23.53 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  22.9 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  27.87 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  25.11 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  31.67 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  29.67 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>