More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28500 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  48.13 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  48.87 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  37.39 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  36.89 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  35.96 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  38.12 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.89 
 
 		 239 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  35.32 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  36.06 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  30.53 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  34.63 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  31.47 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.88 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  31.62 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  34.86 
 
 		 251 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  34.06 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  36.14 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  33.81 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  36.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  33.33 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.94 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  35.44 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  30.57 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  36.9 
 
 		 205 aa  95.9  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  34.41 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  32.29 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  30.67 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  38.04 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16551  putative glucose inhibited division protein B  32.86 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  33.49 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  35.71 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  35.12 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0878  methyltransferase GidB  37.26 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.03 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  35.18 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  38.18 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  33.17 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  31.09 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  33.66 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  36.81 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 206 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  35.93 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 207 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  35.93 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  28.89 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  28.87 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  40.25 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  36.26 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  34.81 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  32.73 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  39.1 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  36.88 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>