More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_14160 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  100 
 
 		 225 aa  453  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  48.87 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  44.39 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  36.62 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  30.63 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  32.29 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.17 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  37.85 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  31.7 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  31.7 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  34.65 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  32.27 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  30.4 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  30.53 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  32.67 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  30.87 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  32.43 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  30.4 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  28.63 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  36.09 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  26.75 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  32.84 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  27.07 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  29.26 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  26.52 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  30.91 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  30.28 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  28.51 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  29.44 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  31.7 
 
 		 244 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.97 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  34.95 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  31.05 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  32.98 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  31.22 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  31.39 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  29.3 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  29.46 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  29.86 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  26.29 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  29.47 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  30.4 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  31.12 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.22 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  30.52 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  36.5 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  28.44 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  34.16 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  27.16 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  31.22 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  27.16 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  34.1 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  29.8 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  28.26 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  27.14 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.72 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  30.97 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  27.88 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  28.82 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  27.7 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  34.94 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  29.95 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  38.26 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  32.76 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  26.43 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  30.36 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  29.07 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  33.12 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  26.58 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  29.76 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>