More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2962 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  40.59 
 
 
226 aa  148  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  42.79 
 
 
222 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  43.27 
 
 
201 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  43.16 
 
 
221 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  40.98 
 
 
212 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  42.72 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  40.95 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  43 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  38.31 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  39.8 
 
 
211 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  37.81 
 
 
206 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  40.7 
 
 
260 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  37.37 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  36.45 
 
 
215 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  39.3 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  41.15 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  39.8 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  40.53 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  41.21 
 
 
277 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  39.68 
 
 
211 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  38.81 
 
 
211 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  39.23 
 
 
237 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  37.44 
 
 
195 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  38.69 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  40.1 
 
 
223 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  38.58 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  38.58 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  37.56 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  37.74 
 
 
211 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  41.98 
 
 
217 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  36.5 
 
 
213 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  36.79 
 
 
209 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  37.5 
 
 
193 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  36.87 
 
 
205 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  38.67 
 
 
221 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  34.85 
 
 
205 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  37.23 
 
 
217 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  35.29 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  34.13 
 
 
240 aa  92  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  30.77 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  36.36 
 
 
239 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  32.73 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.53 
 
 
234 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  35.58 
 
 
238 aa  85.1  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  35.42 
 
 
250 aa  85.1  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  37.72 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  32.22 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  33.72 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  37.22 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  34.76 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  32.53 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  37.89 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  31.58 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  31.14 
 
 
226 aa  82  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  30.65 
 
 
216 aa  82  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  31.37 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  28.89 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.39 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  33.71 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  32.91 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  35.98 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  32.3 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  35.44 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  38.46 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  35.5 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  34.94 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  31.87 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  32.92 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.35 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  33.12 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  31.35 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  34.59 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.9 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  34.94 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  34.15 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  31.89 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  35.58 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.89 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  28.82 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  34.19 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  32.89 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  34.84 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  31.79 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  30.72 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  33.77 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  30.73 
 
 
262 aa  74.7  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  32.74 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  32.7 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  35.33 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  31.9 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>