More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42548 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42548  predicted protein  100 
 
 		 346 aa  712    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0379002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  37.65 
 
 		 222 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07365  glucose-inhibited division protein  36.72 
 
 		 209 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  35.32 
 
 		 207 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 220 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 205 aa  119  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1432  methyltransferase GidB  38.01 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416586  normal  0.596678 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3357  methyltransferase GidB  35.63 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  34.63 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  36.9 
 
 		 219 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1749  16S rRNA methyltransferase GidB  34.59 
 
 		 209 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1194  16S rRNA methyltransferase GidB  35.63 
 
 		 207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0466  16S rRNA methyltransferase GidB  34 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1307  16S rRNA methyltransferase GidB  35.61 
 
 		 221 aa  112  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4081  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 209 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342652  normal  0.185118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 228 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  32.66 
 
 		 210 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  32.35 
 
 		 211 aa  99.4  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  32.84 
 
 		 211 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  36.71 
 
 		 211 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 206 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 206 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 206 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  32.61 
 
 		 239 aa  96.3  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  35.33 
 
 		 214 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  32.08 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  32.16 
 
 		 206 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  32.94 
 
 		 239 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  28.63 
 
 		 234 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  28.71 
 
 		 209 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  34.67 
 
 		 211 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  30.73 
 
 		 209 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 242 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  32.92 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  33.68 
 
 		 208 aa  92.8  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 207 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  29.8 
 
 		 206 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  34.41 
 
 		 207 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  36.3 
 
 		 208 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  31 
 
 		 206 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  28.44 
 
 		 238 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 214 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  32.3 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  32.67 
 
 		 237 aa  90.1  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  35.56 
 
 		 208 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  28.22 
 
 		 212 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  30.15 
 
 		 206 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  31.33 
 
 		 213 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  27.22 
 
 		 241 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  30.15 
 
 		 206 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  30.15 
 
 		 206 aa  89.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 205 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 208 aa  89.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 216 aa  89.4  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 206 aa  89.4  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.64 
 
 		 213 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  31.66 
 
 		 207 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  31.66 
 
 		 207 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  31.66 
 
 		 207 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  28.28 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  28.28 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  27.56 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  28.28 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 239 aa  89  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  30.15 
 
 		 206 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  28.28 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  35.4 
 
 		 214 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  28.16 
 
 		 206 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  31.88 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 207 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 231 aa  87.4  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  27.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  29.7 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  29.15 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  27.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 216 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  29.15 
 
 		 206 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 216 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 207 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 223 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 222 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  29.29 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 216 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  35.09 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  31.36 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  37.68 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  38.28 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>