More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1307 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1307  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1432  methyltransferase GidB  56.31 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416586  normal  0.596678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3357  methyltransferase GidB  52.91 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1194  16S rRNA methyltransferase GidB  54.15 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4081  methyltransferase GidB  52.2 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342652  normal  0.185118 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07365  glucose-inhibited division protein  54.37 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268535  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  52.45 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1749  16S rRNA methyltransferase GidB  52.94 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  51.23 
 
 		 207 aa  201  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0466  16S rRNA methyltransferase GidB  45.19 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  41.58 
 
 		 238 aa  134  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  37.99 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  37.37 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  42.86 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  43.45 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  40.11 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2756  glucose inhibited division protein  37.16 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  36.77 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  36.77 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42548  predicted protein  35.61 
 
 		 346 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0379002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  38.61 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  37.01 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  36.13 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  37.5 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  37.35 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  40.14 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  39.44 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  30.11 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  29.02 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  29.55 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  38.73 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  29.78 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  32.9 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  32.9 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  35.66 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  31.84 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  35.92 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  32.43 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  31.93 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  29.21 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  34.53 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  32.62 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  32.39 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  33.1 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  30.12 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>