More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2756 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2756  glucose inhibited division protein  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1432  methyltransferase GidB  36.27 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416586  normal  0.596678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  37.07 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  41.95 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07365  glucose-inhibited division protein  35.64 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268535  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0466  16S rRNA methyltransferase GidB  34.11 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1194  16S rRNA methyltransferase GidB  34.15 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  40.67 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 205 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  38.5 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3357  methyltransferase GidB  32.67 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4081  methyltransferase GidB  33.66 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342652  normal  0.185118 
 
 
-
 
NC_002950  PG1307  16S rRNA methyltransferase GidB  37.16 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1749  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  36.1 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  34.52 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  36.26 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  35.09 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  35.52 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  37.21 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  26.29 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.68 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  36.56 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  36.02 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.04 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  40.29 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.15 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42548  predicted protein  33.11 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0379002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  34.18 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  39.57 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  37.95 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  32.34 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  35.68 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35.56 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  27.43 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  35.47 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  30 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  33.09 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.3 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  35.09 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  29.65 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  31.39 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  26.86 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  32.93 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  28.17 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  26.74 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  35.23 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  32.39 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  29.14 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  33.71 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  33.83 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  30.81 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  32.93 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.93 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  28.9 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  22.83 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.51 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  28.47 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.56 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  32.56 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  29.34 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  32.41 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  37.27 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  32.52 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  30.99 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1064  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  30.08 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  36.47 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  35.33 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  28.45 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1321  16S rRNA methyltransferase GidB  35 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  34.59 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>