More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1275 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  56.72 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  48.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  47.98 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  48.31 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  47.47 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  48.54 
 
 		 212 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  48.77 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  48.06 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  42.93 
 
 		 221 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  47.67 
 
 		 222 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  46.31 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  54.66 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  44.71 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  44.02 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  47.67 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  47.15 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  44.55 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  44.55 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  43.37 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  45.05 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  44.78 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  43.72 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  40.78 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  42.72 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  43.88 
 
 		 213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  44.1 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  37.86 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  42.22 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  40.59 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  44.86 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  43.88 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  40.51 
 
 		 193 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  39.3 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  47.96 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  38.02 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  41.14 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 210 aa  92.4  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.86 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  35.07 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  41.61 
 
 		 250 aa  88.2  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  34.66 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  42.25 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  36.16 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  38.62 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  35.67 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  33.48 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  35.12 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  35.15 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  38.73 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  35.15 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  34.73 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.9 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  31.79 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  30.68 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  35.09 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  35.09 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  35.47 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  33.84 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  31.67 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  36.71 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  35.22 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  33.68 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  33.16 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  37.66 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.12 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  33.97 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  33.13 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.76 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  32.53 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  31.64 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  38.64 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0466  16S rRNA methyltransferase GidB  28.86 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1194  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.48 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>