More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4859 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  100 
 
 		 205 aa  393  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  55.12 
 
 		 227 aa  217  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  55.22 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  56.02 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  55.5 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  55.12 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  52.94 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  55.08 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  53.43 
 
 		 245 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  51.83 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  51.83 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  51.31 
 
 		 225 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  53.76 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  50.97 
 
 		 236 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  61.54 
 
 		 254 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  51.18 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  51.34 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  52.63 
 
 		 223 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  52.15 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  51.85 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  52.91 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  46.48 
 
 		 250 aa  165  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  56.76 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  51.16 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  49.74 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  49.28 
 
 		 241 aa  160  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  45.27 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  46.73 
 
 		 221 aa  153  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  57.64 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  44.72 
 
 		 306 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  50.99 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  43.75 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  46.03 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  47.68 
 
 		 242 aa  134  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  42.33 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  47.65 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  37.69 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  42.96 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  33.55 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  42.95 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.32 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  32.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  41.18 
 
 		 234 aa  92  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  38.57 
 
 		 236 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  90.5  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.74 
 
 		 216 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  47.15 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 240 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  39.52 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.55 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 238 aa  88.2  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  34.78 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  28.21 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  35.25 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  41.04 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  36.69 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  35 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  34.68 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  30.87 
 
 		 242 aa  85.5  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  38.93 
 
 		 239 aa  84.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  36.24 
 
 		 241 aa  84.7  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  36.62 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  37.06 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  34.19 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  36.62 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  36.62 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  32.53 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  29.44 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  29.44 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  37.8 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  34.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  34.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  34.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  36.17 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>