More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2553 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  64.73 
 
 		 210 aa  274  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  57.58 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  53.85 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  51.72 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  50.52 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  50.26 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  51.04 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  47.18 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  45.24 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  46.12 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  48.22 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  48.76 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  50 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  54.55 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  52.02 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  50.76 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  51.2 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  48.24 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  47.76 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  48.28 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  50 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  45.08 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  47.4 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  48.28 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  43.84 
 
 		 227 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  47.4 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  47.4 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  49.06 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  43.65 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  55.63 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  50.93 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  45.11 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  44.44 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  42.33 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  43.11 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  42.62 
 
 		 306 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  36.72 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  35.96 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  37.27 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.67 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  36.21 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  29.19 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  35.75 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  37.82 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  34.15 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  31.94 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  35.54 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  32.35 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  35.33 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  32 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  30.11 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  28.21 
 
 		 241 aa  84.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  26.16 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  31.48 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  32.68 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  39.02 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  39.02 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  29.34 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.14 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  33.85 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  35 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  26.74 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  43.24 
 
 		 245 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  32.53 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  35.38 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  30.19 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  32.65 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  33.79 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  33.16 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>