More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3590 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  100 
 
 		 226 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  72.65 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  64.97 
 
 		 210 aa  244  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  60.1 
 
 		 245 aa  228  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  55.19 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  60.31 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  57.45 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  55.5 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  53.4 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  52.68 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  54.5 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  48.51 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  50.7 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  51.58 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  50.66 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  50.75 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  53.76 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  49.76 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  51.49 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  51.49 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  47.03 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  50.22 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  59.78 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  48.8 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  50.5 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  49.34 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  50.25 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  48.37 
 
 		 306 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  48.22 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  51.2 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  49.47 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  47.44 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  51.58 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  47.28 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  50 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 255 aa  144  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  48.52 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  33.71 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  33.15 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  32.77 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.21 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  33.15 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  39.51 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  32.76 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  34.71 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  34.34 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  29.85 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  31.84 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  38.03 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  41.03 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  35.66 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  41.61 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  35.66 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  39.86 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  47.41 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  41.94 
 
 		 209 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  37.14 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  43.97 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.27 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  36.23 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  36.08 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  41.8 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.26 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  33.78 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  28.16 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  38.52 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  34.34 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  36.43 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  37.69 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  33.97 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>