More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1441 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  65 
 
 		 255 aa  291  4e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  45.24 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  44.86 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  46.89 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  45.5 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  43.87 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  42.08 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  43.41 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  42.59 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  43.06 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  43.6 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  43.37 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  41.04 
 
 		 242 aa  148  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  42.31 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  42.08 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  40.49 
 
 		 245 aa  141  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  42.94 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  40.65 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  40.19 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  40.19 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  41.12 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  41.85 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  39.71 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  38.39 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  41.85 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  39.3 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  42.16 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  40.1 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  37.98 
 
 		 306 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  41.49 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  38.38 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  32.86 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  39.74 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  39.07 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  28.81 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  36.53 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  27.09 
 
 		 238 aa  92.8  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  26.92 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  26.87 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  30.35 
 
 		 235 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  27.36 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  27.36 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  26.35 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  30.85 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  26.98 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  28.33 
 
 		 242 aa  84.7  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  30.11 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  26.78 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  25.37 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.27 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  28.71 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  29.9 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  27.85 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  28.5 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  30.92 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  29.25 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  27.92 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  23.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  29.73 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  23.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  23.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  23.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  23.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  23.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  23.65 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  29.5 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  30.85 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  23.15 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  23.15 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  27.78 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  25.81 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  31.34 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  25.5 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  31.75 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.87 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.71 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  23.53 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  26.59 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  31.37 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>