More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3722 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  100 
 
 
228 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  57.43 
 
 
210 aa  232  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  55.56 
 
 
242 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  53.85 
 
 
210 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  42.48 
 
 
255 aa  180  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  50.48 
 
 
212 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  53.49 
 
 
236 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  47.21 
 
 
210 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  52.87 
 
 
221 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  49.12 
 
 
241 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  48.73 
 
 
262 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  46.84 
 
 
226 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  43.06 
 
 
221 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  45.36 
 
 
216 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  46.89 
 
 
239 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  50.8 
 
 
223 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  50.33 
 
 
237 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  45.88 
 
 
213 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  49.11 
 
 
245 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  44.28 
 
 
228 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  45.12 
 
 
242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  46 
 
 
250 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  46.88 
 
 
241 aa  147  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  43.35 
 
 
254 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  46.03 
 
 
205 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  46.61 
 
 
242 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  45.32 
 
 
223 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  48.57 
 
 
225 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  52.32 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  44.63 
 
 
222 aa  134  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  42.21 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  41 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  39.39 
 
 
227 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  38.31 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  40.89 
 
 
306 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  39.05 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  37.5 
 
 
221 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  28.73 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 
231 aa  95.1  7e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  32.35 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  33.75 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  36.49 
 
 
236 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  30.23 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  34.9 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  35.27 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  31.95 
 
 
239 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  35.33 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  38.64 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  30.32 
 
 
212 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  32.5 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  31.08 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  29.57 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  30.73 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  30.18 
 
 
228 aa  85.1  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
208 aa  85.1  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  35.03 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  38.93 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  38.93 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  34.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  29.5 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  40.41 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  29.03 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.69 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.69 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  29.21 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  32.07 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  34.81 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  33.95 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  32.93 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.52 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  31.85 
 
 
209 aa  82  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  33.95 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  34.81 
 
 
228 aa  82  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  38.35 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  24.85 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  34.13 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  26.26 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  32 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>