More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  100 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  56.35 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  51.24 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  55.1 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  53.2 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  51.52 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  54.55 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  51.1 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  50.9 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  55.68 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  46.96 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  52.56 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  53.03 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  50.67 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  51.71 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  51.71 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  48.71 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  47.73 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  53.49 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  50.75 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  51.23 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  50.48 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  54.3 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  47.49 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  50 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  45.81 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  50.45 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  48.24 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  46.61 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  46.43 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  52.84 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  51.1 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  53.49 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  53.23 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  48.59 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  41.83 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  46.88 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  40.87 
 
 		 221 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.65 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  35.84 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.3 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  31.53 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  32.46 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  32.46 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  34.68 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  41.92 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  30.24 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  40.48 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.84 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  47.66 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  31.53 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  40.85 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  32.32 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  29.44 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.05 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  35 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  33.33 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  32.58 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  35.38 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  31.46 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  35.19 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  33.71 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  31.46 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  34.87 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  42.04 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  32.26 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>