More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4167 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 228 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  89.25 
 
 		 216 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  62.25 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  55.5 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  51.9 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  54.82 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  53.62 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  50.76 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  53 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  53.23 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  50.93 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  47.03 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  48.06 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  50.75 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  50.75 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  50.51 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  51.96 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  46.04 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  48.22 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  52.91 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  47.37 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  56.41 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  45.45 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  48.99 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  45.71 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  49.43 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  51.47 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  46.73 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  45.5 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  46.7 
 
 		 242 aa  157  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  47.03 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  48.17 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  45.24 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  46.6 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  51.76 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  52.78 
 
 		 236 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  44.28 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  34.32 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  38.01 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  33.86 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.96 
 
 		 241 aa  98.2  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  34.57 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  37.91 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  33.69 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  32.76 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  40.43 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  32.54 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  33.93 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  39.1 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  39.1 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  37.91 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  42.15 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  32.53 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.96 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  30.46 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  40.46 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  34.23 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  32.57 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  38.93 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  31.79 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  33.97 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.78 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  38.1 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  37.27 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  29.94 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  42.03 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  35.42 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  40.15 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>