More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4220 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  100 
 
 		 212 aa  407  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  50.52 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  52.63 
 
 		 242 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  46.84 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  50.8 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  50.48 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  54.66 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  47.47 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  49.43 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  50.54 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  54.91 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  52.84 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  48.53 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  53.8 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  48.81 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  47.57 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  48.04 
 
 		 254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  51.25 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  47.8 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  43.6 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  45.5 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  44.33 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  44.75 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  46.95 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  50 
 
 		 236 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  46.06 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  46.06 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  44.24 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  50.3 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  47.06 
 
 		 262 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  47.65 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  44.39 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  42.79 
 
 		 306 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  43.98 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  40.1 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  41.92 
 
 		 239 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  43.45 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  42.94 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  43.21 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  41.42 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  34.55 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.09 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  30.25 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 241 aa  88.2  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.51 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  39.58 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  39.58 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  29.29 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  29.29 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  38.62 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  28.92 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  32.68 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  33.97 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  37.16 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  29.14 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  29.11 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  36.94 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  32.4 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  28.67 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  30.57 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  25.99 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  32.03 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  31.72 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  31.1 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  25.77 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>