More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0044 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  40.19 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  32.64 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  37.14 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  33.61 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  34.98 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  34.53 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  33.93 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  33.47 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  36.87 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.48 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  30.08 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  33.93 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  33.05 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  34.42 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  34.53 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  34.56 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.41 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  32.71 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  32.08 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  35.78 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  33.66 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  35.78 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  34.69 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  33.64 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  32.58 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  33.94 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  33.48 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  34.71 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.86 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.86 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  31.92 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  31.78 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  29.86 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  31.48 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  31.19 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  29.88 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  34.84 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  27.59 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  28.1 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  29.73 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  29.63 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  34.19 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  32 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  27.12 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  28.9 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  29.7 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.47 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  29.01 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15951  16S rRNA methyltransferase GidB  28.23 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  28.7 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.73 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  43.12 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  23.47 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf113  glucose-inhibited division protein B  32.53 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  32.04 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  29.7 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  30.51 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  35.83 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16651  putative glucose inhibited division protein B  28.99 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  30.61 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  31.1 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  30 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  26.74 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  33.12 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  28.25 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16771  putative glucose inhibited division protein B  28.27 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  33.79 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  33.83 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>