More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0895 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  29.59 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  30.89 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  29.85 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  29.85 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  29.85 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  34.22 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  30.37 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  30.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  29.59 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  30 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  32.83 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  29.74 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  29.74 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  29.74 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  29.74 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  29.74 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  27.86 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  29.74 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  28.43 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  29.23 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  29.21 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  29 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.46 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  30.21 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  32.54 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  31.96 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  30.21 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  31.96 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  31.52 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  32.47 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  28.36 
 
 		 222 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  32.29 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  27.23 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  28.28 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  27.36 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  27.86 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  27.84 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  31.12 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  30.73 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  27.84 
 
 		 214 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  27.36 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.98 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  27.36 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  30.27 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  26.83 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  26.37 
 
 		 228 aa  91.7  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  27.84 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  29.7 
 
 		 239 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.7 
 
 		 239 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  30.27 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  27.32 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  27.6 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  37.06 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  28.42 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1931  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  28.42 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  27.14 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  28.95 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  29.82 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  26.24 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  29.12 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  29.82 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  29.14 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  30.72 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  30.84 
 
 		 238 aa  85.5  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  26.26 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  34.5 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  27.89 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>