More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1863 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  97.63 
 
 
211 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  87.68 
 
 
211 aa  374  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  72.95 
 
 
211 aa  295  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  73.08 
 
 
212 aa  295  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  70.53 
 
 
212 aa  285  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  47.47 
 
 
226 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  52.04 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  49.74 
 
 
222 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  46.57 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  48.48 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  48.48 
 
 
237 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  48.22 
 
 
234 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  47.72 
 
 
277 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  47.09 
 
 
221 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  48.89 
 
 
221 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  47.89 
 
 
223 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  44.1 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  41.43 
 
 
213 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  41.43 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  45.79 
 
 
211 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  40.51 
 
 
210 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  43.92 
 
 
219 aa  147  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 
211 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  40.48 
 
 
213 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  40.2 
 
 
205 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  44.44 
 
 
209 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  39.2 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  39.91 
 
 
213 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  40 
 
 
208 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  38.58 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  37.76 
 
 
195 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  39.3 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  37.2 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  36.71 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  39.69 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  35.96 
 
 
217 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  42.13 
 
 
217 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  39.74 
 
 
210 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  37.04 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  35.09 
 
 
223 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  36.21 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  34.81 
 
 
219 aa  91.3  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  41.03 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  37.18 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  33.54 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  38.26 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  36.31 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  37.93 
 
 
254 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  35.83 
 
 
230 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  36.13 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  39.58 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  34.84 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  35.44 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  36.09 
 
 
237 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  36.02 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  34.78 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  37.23 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  35.76 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  35.9 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  36.54 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  37.02 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  30.73 
 
 
255 aa  78.2  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  31.61 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.87 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  30.52 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  32.89 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  34.19 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  36.77 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  37.25 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  38.26 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  34.51 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  36.94 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.4 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  34.81 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  34.16 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  38.12 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  32.26 
 
 
239 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  32.48 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  29.7 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.35 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  36.11 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  32.32 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  36.99 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  29.78 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  31.9 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  27.06 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.87 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  40.94 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  37.74 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>