More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0295 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  79.63 
 
 		 233 aa  344  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  81.64 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  74.64 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  66.97 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  70.85 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  69.7 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  50 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  47.89 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  47.37 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  43.56 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  44.29 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  42.99 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  46.35 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  44.86 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  44.04 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  41.45 
 
 		 213 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  44.56 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  40.09 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  44.56 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  43.23 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  43.1 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  42.05 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  39.9 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  40.31 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  40.22 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  43.32 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  40.7 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  39.47 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  38.95 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  36.13 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  38.5 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  37.23 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  37.97 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  40.51 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  32.66 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.72 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  35.4 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  35.91 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  32.53 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  36.69 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  35.2 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.48 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  31.93 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.44 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1318  methyltransferase GidB  35.46 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0582047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  38.79 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  29.65 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  36.36 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  38.79 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  35.35 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  31.06 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  31.07 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  32.35 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  31.91 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  38.18 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  32.61 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  32.26 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  37.5 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  38.78 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.8 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  36.48 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  39.41 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  35.75 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  39.41 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  39.07 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  29.12 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  30.69 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  38.27 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  36.91 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4492  methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.82 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  29.31 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  30.95 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  29.21 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.22 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4356  methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  29.45 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.62 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1812  glucose inhibited division protein  31.77 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>