More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4092 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  73.91 
 
 		 211 aa  300  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  72.95 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  71.98 
 
 		 211 aa  291  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  71.9 
 
 		 212 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  70.19 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  51.3 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  48.06 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  47.78 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  47.5 
 
 		 233 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  47.5 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  49.24 
 
 		 277 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  50.52 
 
 		 245 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  47.89 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  43.56 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  45.3 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  46.6 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  46.56 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  44.33 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  40.93 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  43.46 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  44.33 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  45.16 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  42.78 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  41.58 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  43.02 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  41.94 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  41.29 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  40.3 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  39.8 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  40.49 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  38.97 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  39.8 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  36.65 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  41.8 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  40.93 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  38.81 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  44.28 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  38.42 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  35.2 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  35.58 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  35.18 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  35.23 
 
 		 262 aa  88.2  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  36.98 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  35.54 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  40.14 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  36.11 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  37.74 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  35.93 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  37.09 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  33.7 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  35 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  34.52 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  37.34 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.16 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  36.99 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  32.37 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  34.68 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  34.34 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  33.72 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  39.44 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  32.69 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.13 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  37.76 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.56 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  34.57 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  32.21 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  34.71 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  29.22 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  32.17 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  33.71 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0745  glucose inhibited division protein  31.48 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  29.57 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>