More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0012 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  53.14 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  51.96 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  51.47 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  47.6 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  44.55 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  43.08 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  40.82 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  37.86 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  37.76 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  38.27 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  37.37 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  38.27 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  41.36 
 
 		 206 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  41.36 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  36.13 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  38.95 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  36.65 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  37.11 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  34.74 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  36.65 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  34.54 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  37.43 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  36.45 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  31.84 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  37.63 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  39.62 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  36.51 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  31.09 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  33.33 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  29.34 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  29.19 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.29 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.51 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  36.18 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  27.78 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  35.56 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  28.22 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  30.19 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  30.91 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  29.78 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  29.78 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  30.56 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  35.94 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  34.06 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  30.95 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  36.49 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  31.37 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07365  glucose-inhibited division protein  26.88 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268535  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  34 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  32.59 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  32.43 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  34.76 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  30.91 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  28.19 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  32.45 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  28.74 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>