More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1286 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  62.16 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  48.64 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  46.31 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  46.81 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  48.89 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  48.89 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  47.62 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  51.76 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  46.35 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  52.05 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  46.96 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 		 277 aa  154  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  48.21 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  46.6 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  46.29 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  42.11 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  43.5 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  45.4 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  42.78 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  42.64 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  44.33 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  41.71 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  45.7 
 
 		 201 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  43.01 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  43.1 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  43.48 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  41.34 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  43.55 
 
 		 193 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  41.15 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  42.86 
 
 		 195 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  37.43 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  41.27 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  38.67 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  39.76 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35.8 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  43.46 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  33.68 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.73 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  36.31 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  33.7 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  30.38 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  31.93 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.31 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  34.57 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  34.43 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  29.07 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  29.07 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  35.11 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  28.83 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.18 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  36.11 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  32.2 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  34.03 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  31.78 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  27.93 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  31.87 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.64 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  29.44 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  29.51 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  33.33 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  28.98 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  30.52 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.47 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  34.19 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3772  16S rRNA methyltransferase GidB  28.21 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494361  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.5 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  31.46 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  29.83 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  29.77 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>