More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1605 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1605  glucose inhibited division protein  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1318  methyltransferase GidB  47.29 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0582047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1812  glucose inhibited division protein  49.71 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0848  glucose inhibited division protein  47.4 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2293  methyltransferase GidB  44.15 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0745  glucose inhibited division protein  37.95 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  34.01 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  30.88 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  32.81 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  28.8 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  29.77 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  32.16 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.31 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  36.24 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  30.33 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  34.39 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.12 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.1 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  29.49 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  32.46 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  32.19 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  33.55 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  27.05 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  34.42 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  32.77 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.66 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  38.93 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  32.1 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  25.84 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  32.52 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0404  methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  31.48 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  30.82 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  29.08 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  31.33 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.83 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  31.07 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  33.57 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  31.09 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  32.1 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  30.39 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.9 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  27.75 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  30.64 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  30.69 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  29.53 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  23.49 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  28.43 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  28.82 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  28.66 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  28.14 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  36.17 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>