More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0745 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0745  glucose inhibited division protein  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1812  glucose inhibited division protein  49.77 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0848  glucose inhibited division protein  53.81 
 
 
258 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2293  methyltransferase GidB  46.3 
 
 
229 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1318  methyltransferase GidB  42.5 
 
 
219 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0582047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1605  glucose inhibited division protein  37.95 
 
 
214 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  28.16 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  29.24 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  31.94 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  29.22 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  27.68 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  26.99 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  30.9 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  30.58 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  26.98 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  26.18 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 
214 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  27.65 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.11 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  33.68 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  33.12 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  30.46 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  27.06 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  33.12 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.12 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  32.9 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  29.65 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  31.17 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  30.13 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  27.4 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  32.43 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  29.68 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.07 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  31.14 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  30.32 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  30.13 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  33.11 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.5 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.5 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.5 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  30.41 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  32.65 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  27.16 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  27.37 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  27.37 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.15 
 
 
216 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  31.97 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  29.7 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  29.26 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  26.47 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  25.73 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  31.06 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.08 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  29.22 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  27.53 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  28.08 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  29.02 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  33.73 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  31.12 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  26.23 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  27.4 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  33.6 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  32.31 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  29.93 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  32.68 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  28.99 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  27.6 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  26.23 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  30.92 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0404  methyltransferase GidB  33.58 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  27.43 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  25.71 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  32.05 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  29.41 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  30.72 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  31.48 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  31.62 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  30.82 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  25.97 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  25.24 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  25.51 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>