More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1077 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  100 
 
 		 188 aa  376  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1015  methyltransferase GidB  97.34 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0089498  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0792  methyltransferase GidB  95.74 
 
 		 188 aa  363  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00321601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  56.52 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0882  methyltransferase GidB (glucose-inhibited divisionprotein B)  47.34 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  46.29 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1576  methyltransferase GidB  42.86 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1345  methyltransferase GidB  43.35 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  37.29 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0376  methyltransferase GidB  32.43 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.326616  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.33 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  30.19 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  30.97 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  34.15 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  29.94 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  30.59 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.7 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.9 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  29.19 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  35.44 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  30.95 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  27.95 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  30.08 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  31.89 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  32.52 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  27.5 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  27.22 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  31.36 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  27.74 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  27.74 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  27.74 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  27.74 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  29.14 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  30.86 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  29.01 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  27.74 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  26.14 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  24.2 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  25.29 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  33.89 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  33.12 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  25.6 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  25.6 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  25.6 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  29.82 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  30.06 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  28.89 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  25.68 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  27.5 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  27.97 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  26.83 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  31.95 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  26.54 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  33.09 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  27.47 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  36.13 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  27.56 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  24.43 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  27.38 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  27.95 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  27.78 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  24.31 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  27.95 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  25.44 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  28.99 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6890  methyltransferase GidB  27.17 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  29.78 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>