More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2448 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2470  dihydroxy-acid dehydratase  74.96 
 
 		 567 aa  844    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2834  dihydroxy-acid dehydratase  85.39 
 
 		 568 aa  994    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3950  dihydroxy-acid dehydratase  65.3 
 
 		 587 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1318  dihydroxy-acid dehydratase  83.89 
 
 		 575 aa  941    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0453  dihydroxy-acid dehydratase  82.86 
 
 		 571 aa  910    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3247  dihydroxy-acid dehydratase  89.93 
 
 		 569 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.652611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3191  dihydroxy-acid dehydratase  85.39 
 
 		 566 aa  988    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3810  dihydroxy-acid dehydratase  65.19 
 
 		 584 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2216  dihydroxy-acid dehydratase  89.22 
 
 		 569 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3955  dihydroxy-acid dehydratase  67.91 
 
 		 570 aa  784    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5831  dihydroxy-acid dehydratase  64.42 
 
 		 590 aa  710    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4562  dihydroxy-acid dehydratase  64.85 
 
 		 570 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3757  dihydroxy-acid dehydratase  72.19 
 
 		 570 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2448  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 568 aa  1140    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6261  dihydroxy-acid dehydratase  64.17 
 
 		 584 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  64.71 
 
 		 582 aa  727    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  63.88 
 
 		 629 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.93636 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05138  hypothetical dihydroxyacid dehydratase (Eurofung)  56.29 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5997  dihydroxy-acid dehydratase  56.51 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  50.28 
 
 		 586 aa  531  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  52.02 
 
 		 580 aa  524  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  48.99 
 
 		 578 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  48.81 
 
 		 576 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 		 586 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 580 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  48.8 
 
 		 594 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 600 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 569 aa  508  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 		 575 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  49.1 
 
 		 580 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 580 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 		 579 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 576 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  48.71 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 575 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 578 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 578 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 576 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  47.58 
 
 		 574 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  48.15 
 
 		 580 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 578 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  51.18 
 
 		 569 aa  498  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  48.37 
 
 		 572 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 		 581 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 578 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 578 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  46.49 
 
 		 601 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 		 582 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  48.19 
 
 		 579 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  48.2 
 
 		 574 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  48.09 
 
 		 579 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 578 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  47.49 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  48.36 
 
 		 577 aa  495  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  48.71 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 583 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  47.97 
 
 		 577 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  47.99 
 
 		 578 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  48.84 
 
 		 583 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  48.84 
 
 		 583 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  48.2 
 
 		 586 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  47.47 
 
 		 568 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  47.98 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  48.48 
 
 		 583 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  47.44 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  48.02 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  48.02 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 		 583 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  46.62 
 
 		 569 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 		 574 aa  485  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  48.48 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  45.86 
 
 		 573 aa  485  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  49.12 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  47.79 
 
 		 580 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 		 580 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  47.65 
 
 		 579 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 582 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  46.67 
 
 		 581 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 577 aa  482  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  45.99 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  46.24 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  45.67 
 
 		 569 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  46.84 
 
 		 581 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  47.99 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  45.99 
 
 		 577 aa  475  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  45.55 
 
 		 570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  48.8 
 
 		 579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 		 579 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 		 579 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  46.78 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  45.21 
 
 		 586 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  45.27 
 
 		 579 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>